2020年初，一场突如其来的疫情导致本该于3月29日进行的航班换季工作推迟到了5月3日。随着春暖花开，复工复产、复学的有序推进，5月3日起，呼伦贝尔机场将开始执行夏航季航班计划，新开、复飞多条航线，为经济交流和人员流动提供支持，助力呼伦贝尔地区的复工复产、复学。
2020年夏航季换季后呼伦贝尔机场计划执行航线62条，通达城市50座，日均起降114架次。新开通了呼伦贝尔=北京大兴、呼伦贝尔=赤峰=呼和浩特两条航线。换季后通往呼和浩特的航班将达到每日13班，通往北京方向的航班将达到每日6班，通往青岛、长沙、哈尔滨、沈阳、济南、天津等重点城市的航班将达到每日2-3班，加密了通往赤峰、郑州、广州等城市的航班，航线网络进一步丰富，能够满足市民的出行需求。
换季初始，日均航班数预计能够达到22-24班，航班数环比4月份增加了3倍。受到疫情的影响，航空公司可能会临时取消航班，或者出现航班时间变动的情况，旅客在出行时要随时关注航班情况，以免耽误出行。
截止4月底，呼伦贝尔机场已经恢复北京首都、北京大兴、呼和浩特、赤峰、天津、青岛、成都、深圳、昆明等国内航线。通用航空恢复了海拉尔至莫旗航线，班期为每日1班。国际和地区航线由于疫情管控原因暂未恢复。
为了确保机场运行安全持续可控，各项疫情防控工作扎实推进，结合“抓作风、强三基、守底线”安全整顿活动相关要求，呼伦贝尔机场开展了各保障部门在换季前完成安全自查和工作部署。设施设备方面。各保障部门对所属保障设施设备进行全面排查，确保换季后所有保障设备能够安全运行。还未进行换季保养的设备，要尽快完成保养工作。已经停用准备再次启用的设备，要在启用前进行测试和保养维护。各部门要加强设施设备管理，确保其一直处于安全可用状态。
人员班制编排方面。根据换季后的航班量及保障人员数量，提前制定各岗位班制，要做到各岗位人员满足日常保障需求，不出现空岗、漏岗情况，同时也要加强部门值班领导巡视检查工作，监督各保障岗位在岗情况。
员工思想动态方面。换季后，每日起降架次将有较大变化，保障压力也将有所增加。各部门提前做好动员部署，及时做好心理疏导工作。结合“抓作风、强三基、守底线”安全整顿活动，不断加强员工工作作风建设，强化三基基础，守住安全底线。
为加快恢复航线航班，呼伦贝尔机场将通过协调地方政府加大政策及资金支持力度、推动航空公司淡季运营航空市场、加大宣传推广力度等举措在常态疫情防控形势下尽快恢复航空市场，为地方经济社会的发展注入活力。
