2013年12月11日交通运输部副部长何建中在“第三届两岸海运论坛”上提出了加快推进两岸直航升级发展的四项政策措施，措施之三是“编制发布海峡两岸集装箱运价指数，引导两岸集装箱运输市场健康有序发展”。为此，上海航运交易所和厦门航运交易所紧锣密鼓地联合开展指数研究相关工作，台湾海峡两岸间集装箱运价指数（简称“TWFI”）于2014年4月2日开始对外试运行。
TWFI在典型性、覆盖性、代表性、公正性等方面具有科学、合理的设计。为全面表征大陆各地区与台湾地区之间的集装箱班轮运输市场总体供需关系和市场景气程度，TWFI的分航线运价指数采用拉式指数计算方式，反映了航线平均单箱运费收入的变化趋势；在样本采集范围上，涵盖了参与经营TWFI涉及的台湾海峡两岸间班轮航线的主要班轮企业，具有极强的市场代表性；在数据报送方面，采用网上报送的方式，保障了运价数据在报送过程中的信息安全、数据及时、传送稳定。试运行期间，TWFI于每周三（除节假日外）下午发布北方—台湾、华东—台湾、东南—台湾往返6条典型航线的分航线运价指数，各分航线运价指数以2014年1月22日为基期，基期指数1000点。
自1998年以来，上海航运交易所先后发布了中国出口集装箱运价指数（CCFI）、中国沿海（散货）运价指数（CBFI）、中国进口干散货运价指数（CDFI）、中国进口油轮运价指数（CTFI）等四大系列指数，在国内外航运界引起较大反响，产生了相当大的经济和社会效益，并以其科学性、客观性和权威性而成为国内外港航相关企业生产经营、商务谈判和发展战略制定的重要参考依据，以及咨询公司、投行和基金公司等衡量航运市场景气程度的重要标识。
2012年12月24日交通运输部发布了《关于台湾海峡两岸间集装箱班轮运价备案实施的公告》，同时要求“由上海航运交易所和厦门航运交易所共同编制并发布两岸集装箱运价指数”。为此，两家交易所在交通运输部的指导下，自2012年12月以来一直致力于台湾海峡两岸间集装箱运价指数的研究工作，多次在上海、厦门等地组织召开航运公司座谈会，走访了大量涉及两岸直航航线的班轮运输企业，合作研发了台湾海峡两岸间集装箱运价指数（TWFI）。TWFI的发布，将全面反映两岸间集装箱运输市场供需态势与价格变化，有利于促进海峡两岸间经贸往来与合作交流，加快推进两岸直航升级发展，为各类市场主体的经营和政府部门的宏观调控提供更好的参考依据。
