受金融海啸冲击，以出口货源为主的深圳港吞吐量正持续滑坡。香港文汇报报导，深圳交通局副局长马勇智预测，深圳港今年集装箱吞吐量成长可能只有3%至4%，而去年有14%的成长。 

　　报导指出，由于2009年外贸前景不佳，深圳港不得不向内发展，与航运公司协作开辟国内贸易货源，但这将威胁到经营国内贸易运输为主的广州港。在广州港力保江山，加上深圳港转型自救，势必将掀起一场争货战。 

　　金融危机使全球贸易量严重滑坡，以外贸航线为主的深圳各港口也受冲击。据统计，今年1至6月，深圳港集装箱吞吐量滑坡到7.2%，是首次出现负成长，至10月更滑坡到4.19%。业界指出，深圳港运量长期都是两位数成长，今年状况实属罕见。 

　　深圳港中拥有近40条北美航线的盐田港区，因美国采购商订单剧减，航运公司不得不撤船、并线、减少或兼用舱位，将美国航线舱位转至其他航线。虽然盐田港及时调整航线，新辟欧洲线和东南亚线，但当前效果不明显。 

　　业界人士表示，盐田港“转辟欧亚航线”的成效不明显，美国的经济问题已向欧亚蔓延。当前欧洲和亚太地区经济成长也已滑坡，前两年一直保持两位数成长的亚太至欧洲航线，今年成长幅度仅有个位数。在珠三角各港口中，香港、深圳、广州三大港口的差异化定位一直都很明确：香港和深圳主要以国际航线为主，广州以国内贸易航线为主。如今深圳港不得不向内发展，开辟新的国内航线，港口间关系更为紧张。