2006年以来，张家港保税区进口棉花仓储保持快速增长态势，1-5月份，该区进口棉花仓储量达7万吨，比2005年同期增长19.5倍，已成为江苏最大的进口棉花仓储分拨基地。
近年来，受用棉量增加、棉花种植面积减少等诸多因素影响，我国棉花缺口逐步加大，每年需从国外大量进口，而受棉花配额发放时间限制，许多进口商和外商在国内配额不足的情况下，将大量棉花发到保税区仓库仓储，使张家港保税区进口棉花仓储大幅增长。同时，2006年张家港保税区充分利用保税仓储分拨优势，筹建了棉花交易市场，为全国棉花贸易商提供了一个快捷、公平的交易平台。此外，张家港保税区海关采取措施，开通了新疆阿拉山口与张家港保税区之间的快速转关通道，为中亚棉花进入华东地区市场创造了有利条件，2006年以来张家港保税区来自乌兹别克斯坦的棉花已超过2万吨。
