拉萨海关隶属日喀则海关位于距拉萨277公里的西藏第二大城市日喀则市，沿318国道（中尼公路）可达拉萨市、樟木口岸。主要公路路况较差，在夏季因雨水及地质关系偶尔会短暂中断。

　　日喀则海关管辖除聂拉木县以外的日喀则地区海关业务。管辖区南面与不丹、尼泊尔接壤，边境线长1354公里，辖区内有吉隆口岸（对尼泊尔，国家一类口岸）、日屋口岸（对尼泊尔，国家二类口岸）,亚东监管点（亚东中印乃堆拉边境贸易通道）。

　　日喀则海关平均海拔3836米，地形以高原为主，高原风光特征明显。气候为高原温带半干旱季风气候，年平均温度为摄氏6.3度，7月最热，最高温度可达摄氏28.2度，1月最冷，最低温度为摄氏零下25.1度，年无霜期为168天。昼夜温差较大。

　　日喀则海关管辖地区面积较大，进出境通道较多。该关主要以边民互市贸易监管、边境查私为主，近年来查获的主要走私物品为黄金、毒品、文物、反动宣传品和濒危动物皮、毛、骨等。